Aunque sí que produce cierta molestia no podemos considerar la fotodepilación un método doloroso y si la comparamos con cualquier otro método depilatorio (cera, depilación eléctrica) la fotodepilación es el menos molesto.

Puede notarse cierta sensación de "pellizco" pero que no precisa anestesia y es siempre bien tolerada por todos los pacientes.

Esta molestia se produce por la afectación del nervio que inerva al pelo en el momento de la descarga lumínica.

En cualquier caso, los métodos de enfriamiento que acoplan la mayor parte de los sistemas de fotodepilación colaboran a disminuir la molestia.